1969'da İran'ın Reşt kentinde doğan Satrapi'nin ailesi Marksist örgütlerle ilişkili ve Şah karşıtıydı. Ancak 1979'daki İran İslam Devrimi'nin ardından bu kez de aşırı dincilerle mücadele etmek zorunda kaldılar. Bu dönemde Satrapi lise eğitimi için Viyana'ya gönderildi, lise yıllarını burada geçirdikten sonra İran'a geri döndü ve İslami Azad Üniversitesi'nde Görsel İletişim Bölümü'nden lisans ve master diplomalarını aldı. Rıza adlı bir adamla 3 yıl evli kaldıktan sonra ülkesinden ayrılarak Fransa'ya yerleşti.
Fransa'da çizgi roman kariyerini başarıyla sürdüren Satrapi'nin Persepolis serisi büyük ilgi gördü ve 2007'de sinemaya da uyarlandı. Başka filmler de yöneten sanatçı, İsveçli Mattias Ripa ile evlidir ve Paris'te yaşamaktadır.